贺云南始终没有成功对大先生下手，而大先生马上就要去南京政府就职了，这让袁世凯非常不满，袁世凯给贺云南下了最后的命令，要他无论如何要除掉大先生，阻止他前往南京就职。而为了能够探听到大先生前往南京的时间和路线，程芳菲再次找到了胡进，胡进按照杜一淳的意思，告诉程芳菲大先生明天坐专列去南京。贺云南知道后立刻让人把仓库里的炸弹全部取出，他准备把炸弹埋在去南京的铁道上。
杜一淳已经察觉到了贺云南会在铁路上做文章，他决定将计就计。胡进在杜一淳的授意下，再次找到了程芳菲，故意告诉她专列的发车时间是十二点，不过没想到的是这一次程芳菲认为胡进已经失去了利用价值，她在酒里下了毒，在得知专列的发车时间后，程芳菲立即通知了贺云南，而与此同时，喝了酒的胡进毒发了，这个时候胡进才告诉程芳菲自己透漏给她的是假情报，程芳菲赶紧准备去通知贺云南，胡进没有给她机会，临死前，他向程芳菲扣动了扳机，最终两个人同归于尽了。
钱泰在发现程芳菲的尸体后非常伤心，他责怪这一次都是因为贺云南，贺云南同样也很伤心，毕竟他和程芳菲从小一起长大，更是经历了很多的难关，也正是因为程芳菲的死，贺云南终于清醒过来了。而时家姐妹和杜一淳同样因为胡进的牺牲而感到伤心，不过他们现在还有更加重要的任务要做，那就是护送大先生准时安全的前往南京就职。
第二天，大先生乘坐专列准时从上海出发前往南京，杜一淳等人已经意识到了此行的凶险，不敢有半点的懈怠，他们分头对所有的车厢进行检查。在经过一个车厢时，雨梅发现一个列车员要去给大先生送水果和点心，雨梅要求进行检查，然而就在餐盒打开的一瞬间，雨梅被迷晕了，当她再次醒来时，自己被绑在了贺云南的面前，她知道贺云南要对大先生不利，她希望劝服贺云南收手，可是贺云南不肯，他还告诉雨梅自己已经在火车上装满了炸弹，就算自己杀不了大先生，自己也要跟大先生同归于尽。
贺云南终于开始行动了，不过他刚刚开始行动，就跟杜一淳遭遇上了，当发现雨梅不见时，杜一淳便开始做好了准备。杜一淳不想伤害无辜，让平民先行离开，然后双方的人在车厢里大打出手，而贺云南的目标则并非杜一淳，他悄悄派钱泰等人从火车车厢上面去找大先生，不过是雨萌等人早有准备，最终除了钱泰以外的所有人全部被除掉了。而车厢那边，杜一淳和贺云南还在激战中，这个时候钱泰跑来缠住杜一淳，好让贺云南去引爆炸弹。
贺云南准备爬上车厢，准备去引爆炸弹，但却被雨梅拦住了去路，雨梅为了不让贺云南滥杀无辜，挣脱了捆绑，在这里拦住了贺云南，虽然雨梅并非贺云南的对手，但是她还是奋力阻拦贺云南，这个时候杜一淳也赶了过来，在那之前，他已经让人把所有的炸弹全部拆除了，贺云南所有的希望破灭了，他准备跟杜一淳鱼死网破，这时雨萌开了枪，眼看着贺云南马上就要中枪坠车，雨梅想要拉住他，而贺云南则挣脱了雨梅的手，带着对雨梅的爱，摔下了列车。
在时家姐妹和杜一淳还有众多革命同志的保护下，大先生最终顺利的到达南京就职南京政府大总统。而在南京，雨萌也再次遇到了郭壁瑜，此时的郭壁瑜也已经加入了民国政府，他将和时家姐妹一起继续为革命事业而奋斗和努力。
(全剧终）